f) Aktywność telomerazy jest kontrolowana przez białko TRF1 promujące tworzenie struktury telomerów typu pętli t

b) Telomeraza jest aktywna tylko w wybranych typach komórek

e) Terapia powodująca inaktywację telomerazy powinna byd skuteczna w walce z rakiem, tylko wtedy gdy aktywacja telomerazy jest przyczyną powstania raka, a nie skutkiem.

a) Telomeraza jest polimerazą RNA zależną od DNA.

d) Aktywność telomerazy jest kontrolowana przez białko TRF1, które wiąże się z powtarzającymi się sekwencjami telomerowymi

c) Telomeraza syntezuje tylko jeden z łaocuchów polinukleotydowych telomeru korzystając z matrycy bogatej w reszty G.

g) Żadne z powyższych twierdzeo nie jest prawdziwe.

e) Ilośd zachodzących inicjacji transkrypcji polimerazy RNAII, zależy od tego, które moduły promotorowe danego genu w danym czasie są związane ze specyficznymi białkami

a) Inicjacja transkrypcji u Eukaryota różni się od inicjacji transkrypcji jaka ma miejsce w komórkach bakteryjnych, między innymi tym, że podstawowy poziom inicjacji transkrypcji eukariotycznej jest stosunkowo wysoki dla większości promotorów, z wyjątkiem najsłabszych.

d) Aktywatory transkrypcji są istotne dla inicjacji transkrypcji przez polimerazy RNAII i RNAIII, natomiast ich rola w przypadku polimerazy RNAI przeprowadzającej transkrypcję wielokrotnie powtórzonej jednostki transkrypcyjnej zawierającej sekswencję kodującą niektóre z rybosomalnych RNA nie jest dobrze określona.

f) Żadne z powyższych twierdzeo nie jest prawdziwe.

c) Powszechną cechą aktywatorów transkrypcji jest ich zdolnośd do bezpośredniego oddziaływania z kompleksem preinicjacyjnym polimerazy RNAII przez tzw. domenę poliprolinową

b) Koaktywator, to białko, stymulujące inicjację transkrypcji przez specyficzne bezpośrednie wiązanie DNA.

d) Te geny z reguły nie są położone w sąsiedztwie wysp CpG

a) Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów charakteryzuje wysoki poziom metylacji.

f) Żadne z powyższych twierdzeo nie jest prawdziwe.

e) Wyspy CpG nie są metylowane tylko w tych tkankach, w których specyficznej ekspresji ulega sąsiadujący z nią gen metabolizmu.

b) Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów są metylowane w niektórych tkankach, ale nie we wszystkich.

c) Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów nie są metylowane

c) Niektóre podstawowe czynniki transkrypcyjne (TFIID, TFIIA i TFIIH) pozostają związane z promotorem umożliwiając reinicjację.

d) Wszystkie podstawowe czynniki transkrypcyjne oddysocjowują.

b) Domena C-koocowa (CTD) polimerazy jest zaktywowana ze względu na defosforylację jaka miała miejsce w czasie pierwszej inicjacji.

e) Niektóre podstawowe czynniki transkrypcyjne (TFIID, TFIIA, TFIIH) pozostają związane z polimerazą RNA umożliwiając reinicjację.

f) Żadne z powyższych twierdzeo nie jest prawdziwe.

a) Wszystkie podstawowe czynniki transkrypcyjne pozostają związane z promotorem umożliwiając reinicjację.

b) piętnowaniu podlegają tylko geny kodujące białka.

e) jeden z pary alleli ulega metylacji w procesie zależnym od tzw. elementów kontrolujących piętnowanie.

a) jest to bardzo często występująca cecha genomów ssaków.

f) żadna z odpowiedzi nie jest prawdziwa.

c) Skutkiem piętnowania jeden gen z pary alleli ulega ekspresji, drugi jest metylowany i wyciszany.

d) funkcją piętnowania jest to, że DNA pary alleli (obu jednocześnie) homologicznych podlega metyzacji, co skutkuje brakiem ich ekspresji.

a) jest miejscem ekspresji genów kodujących białka

b) jest rusztowaniem chromosomowym zmieniającym swoją strukturę w czasie podziału komórki co prowadzi do kondensacja chromosomów

e) jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAII

e) jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAI

d) jest miejscem obróbki cząsteczek mRNA

c) jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

c) Sekwencje intronowe nie są usuwane z transkryptów RNA i podlegają translacji do białek.

e) Składanie w układzie trans zachodzi w sposób podobny do składania przebiegającego z wycinaniem intronów GU-AG, z tym że zamiast lassa tworzona jest struktura widełek.

b) Następuje zastąpienie wybranych eksonów w niektórych transkryptach przez ekson liderowy.

d) Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.

a) Niektóre RNA uczestniczące w tym procesie zawierają informację z dwóch genów, co skutkuje jednoczesną translacją, prowadzącą do dwóch produktów białkowych.

f) Składanie w układzie trans jest powszechnym zjawiskiem w odniesieniu do transkryptów genów człowieka

f) Rybosom dochodzi do konca sekwencji kodującej, uwalnia właściwie zsyntezowane białko i rozpoczyna syntezę nowego białka począwszy od następnego kodonu inicjacyjnego.

b) W czasie translacji cząsteczek RNA rybosomu pomija kodon.

c) Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

d) Rybosom kooczy translację na kodonie, który koduje aminokwas.

e) Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Rybosom przeprowadza translację cząsteczki tRNA, która zawiera jeden dodatkowy nukleotyd lub brakuje w niej nukleotydu.

f) Żadna z powyższych odpowiedzi nie jest prawdziwa.

b) Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji , podczas którego polimeraza dokonuje wyboru pomiędzy kontynuowaniem elongacji a terminacją

d) Może byd kontrolowane przez tzw. białko antyterminacyjne, którego obecnośd zapobiega, np. zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zaleznym od białka Rho

a) następuje mniej więcej w połowie przypadków w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencje odwróconego palindromu.

c) może byd zależne od białka Rho, które posiada aktywnośd helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie ‘rozbijad’ pary zasad pomiędzy matrycą a ciągiem reszt Ustruktury spinki do włosów transkryptu.

e) może byd skutkiem specjalnego rodzaju kontroli, zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i białka

c) może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

b) może przebiegad w procesie w którym następuje usuwanie czapeczek skutkiem czego dochodzi do usunięcia łaocuchów poliA, co z kolei prowadzi do braku translacji mRNA i szybkiego i szybkiego trawienia eksonukleotydów.

a) może uczestniczyd w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.

d) może zachodzid w kierunku od 5’ do 3’ lub 3’ do 5’ w odróżeniniu od degradacji w komórkach bakteryjnych, która zawsze zachodzi w kierunku od 3’ do 5’

f) może zależed od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu

e) w prawidłowej, niezmienionej komórce (tzn. niezainfekowanej wirusami i nietransformowanej egzogennym DNA) może byd skutkiem wyciszania RNA (interferencji RNA)

e) który zachodzi przy udziale złożonych kompleksów białkowych np. Swi/Snfi i wpływa na ekspresję całego genomu

b) który wiąże się z intensywnymi modyfikacjami chemicznymi histonów

a) który jest bezwzględnie konieczny dla rozpoczęcia transkrypcji genu.

c) który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA

f) Żadne nie jest prawdziwe

d) które może skutkowad tzw. przemieszczeniem cis, skutkujący transportem(?) nukleosomu na inną cząesteczkę DNA

b) trzy

f) cztery

e) To się zmienia mogą byd dwa lub jeden

c) jeden

d) To się zmienia mogą byd trzy albo dwa

a) dwa

e) Dwuniciowe interferujące cząsteczki RNA są wytwarzane z prekursorowego RNA kodowanego w genomie komórki.

b) Dwuniciowe cząsteczki RNA wiążą się z białkami, które blokują ich translację.

a) Antysensowne cząsteczki RNA przyłączają się do nie ulegającego translacji regionu 3’ docelowego RNA

f) Interferencja RNA może być przyczyną braku produktu białkowego kodowanego przez transgen.

d) Krótkie interferujące cząsteczki RNA wiążą się z rybosomem, aby zapobiec translacji wirusowych mRNA.

c) Dwuniciowe cząsteczki RNA są cięte przez nukleazę na krótkie interferujące cząsteczki RNA.

b) sekwencje mające zdolność znoszenia efektu pozycyjnego, przejawiającego się w nieobecności izolatorów zamiennością lokalizacji, w której wbudowywany jest rekombinowany gen.

d) sekwencje które najprawdopodobniej do spełnianie swych funkcji wymagają białek wiążących specyficznie zarówno izolatory jak i sieć włókien zbudowanych z RNA i białek przenikających całe jadro.

c) Sekwencje utrzymujące niezależność domeny funkcjonalnej zapobiegają „wymianie informacji’’ między sąsiednimi domenami.

f) Sekwencja występująca wyłącznie w genomie Drosophilia melanogaster.

a) sekwencje o długości 1-2 kb wyznaczające granice domen, tzw. domen funkcjonalnych charakteryzujących się zwartą strukturą

e) sekwencje które w swoich normalnych położeniach izolują poszczególne geny danej domeny funkcjonalnej –

f) w jej skład wchodzi np DNA centromerów i telomerów.

h) zawiera ona DNA który ma zwartą strukturę

b) w jej skład wchodzi DNA nie zawierający żadnych genów.

g) w rejonach, w których występuje heterochromatyna konstytutywna można zaobserwować przy pomocy mikroskopu elektronowego pętle zbudowane z włókna chromatynowego

c) w jej skład wchodzi DNA nie kodujący żadnych genów

a) można ją obserwować czasami w pewnych komórkach.

d) zawiera ona geny nieaktywne w pewnych komórkach lub na niektórych etapach cyklu komórkowego

e) jest ona głównym składnikiem ludzkich chromosomów płci

d) Moduły odpowiedzi(response modules)

e) Moduły konstytutywne

f) Moduł w kształcie palca cynkowego

a) Moduły komórkowo specyficzne

c) Moduły represorów

b) Moduły regulatorów rozwoju

a) łączy inicjatorowy tRNA z dużą podjednostką rybosomu w czasie inicjacji translacji.

f) żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe.

c) Blokuje grupę aminową Met, dzięki czemu translacja zachodzie w kierunku N> C

b) Wiąże cząsteczkę GTP potrzebną w procesie formowania kompleksu inicjacyjnego.

e) Blokuje łańcuch boczny Met tak, że nie może ona oddziaływać z czynnikiem inicjacyjnym IF3.

d) Blokuje grupę aminową Met, dzięki czemu translacja zachodzi w kierunku C> N.

e) Topnienie struktury podwójnej helisy DNA w miejscu inicjacji replikacji zachodzi w obrębie subdomeny B3.

f) Żadne z powyższych twierdzeń nÌie jest prawdziwe

b) Typowa ARS, autonomicznie replikująca sekwencja, składa się z dwóch subdomen A i B1 które razem stanowią sekwencję rozpoznawaną przez białka inicjacyjne kompleksu ORC.

d) Typowa sekwencja ARS jest zwykle dłuższa niż oriC w genomie E.coli

c) Kompleks ORC działa jako pośrednik pomiędzy miejscem inicjacji replikacji z sygnałami regulacyjnymi odpowiedzialnymi za koordynację inicjacji replikacji z cyklem komórkowym.

a) Identyfikacji sekwencji istotnych dla inicjacji replikacji DNA w tych komórkach dokonano stosując techniki badawcze wcześniej użyte do ustalenia sekwencji oriC bakteryjnego.

f) żadna z powyższych informacji nie jest prawdziwa.

c) rola glukozy, w odpowiedzi diauksycznej operonu latozowego polega na tym że wywiera ona pośredni wpływ na aktywator kataboliczny (CAP, ang catabolite activator protein) dokonuje tego przez hamowanie aktywnośći cyklazy adenylowej.

e) bezpośrednie oddziaływanie związku sygnalizującego z białkiem regulacyjnym obecnym w komórce ma miejsce tylko w przypadku komórek eukariotycznych

d) aktywatory transkrypcji, należące do nadrodziny receptorów jądrowych, są głównym celem dla hormonów steroidowych związków sygnalizujących wnikających do komórki i kordynujących szeroki zakres aktywności fizjologicznych u wyższych eukariontów .

b) laktoferyna, białko znajdywane w mleku ssaków, a w mniejszej ilości w krwioobiegu pełni rolę zewnątrzkomórkowego związku sygnalizującego, który może stymulować transkrypcję specyficznych genów.

a) związek sygnalizacyjny, który jest białkiem, może działać, na przykład przez oddziaływanie z eksonowymi wzmacniaczami lub wyciszaczami składnika RNA.

f) Metylacja DNA de novo to u myszy proces metylacji zależny od metylotransferaz DNA kodowanych przez geny Dnmt3a i Dnmt3b.

e) Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowanych do DNA, w miejscach komplementarnych do miejsc metylowanych w nici rodzicielskiej.

a) Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowych do DNA w nowym miejscu, prowadzące do zmiany wzoru metylacji genomu.

c) Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowanych do promotorów, aktywujące ekspresję genów.

d) Metylacja DNA de novo sktutkuje przyłączeniem grupy metylowanej do reszty guaniny wchodzącej w skład niektórych sekwencji 5’CG3’ a u roślin 5’CNG3’

e) Niektóre z intein są specyficznymi endonukleazami zdolnymi do usuwania specyficznej sekwencji DNA w allelu który nie zawiera sekwencji kodującej inteinę

b) Inteina to zewnętrzny lub wewnętrzny fragment białka usuwany przez cięcie proteolityczne prowadzące do powstania aktywnego białka.

c) Inteina jest usuwana bezpośrednio po zakończeniu transkrypcji, czemu towarzyszy łączenie zewnętrznych segmentów, t.j ekstein.

a) Wycinanie intein jest odpowiednikiem wycinania intronów z premRNA

f) po wycięciu inteiny, eksteiny łączone są przez specyficzną ligazę białkową

d) Większość intein zidentyfikowano w białkach wyższych eukariotnów.

b) Przemieszczenie trans

a) Acetylacja

c) Metylacja

f) sumoilacja (dołączenie białka SUMO)

e) remodelowanie

d) Ubikiwitynacja

a) kaseta Pribnowa

d) rejon –35

c) kaseta Hognessa

b) kaseta CAAT

e) sekwencja zawierająca wiele reszt purynowych

a) nie potrzebuja ATP

c) gyrazawymaga ATP, odpowiada za superskręty

d) Jest semikonserwatywna

b) topoizomeraza I tnie dwie nici, topoizomeraza II tnie jedną nić

c) uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

d) SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka

e) Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błone

a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie sa odcinane po przejściu przez błonę ER

b) cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 ahelis

e) heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli

d) sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

b) typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA

c) promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

h) mRNA policistronowe

b) czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP

d) peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

e) fMettRNA f zajmuje miejsce P jako jedyne

a) poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hudrolizującego ATP

c) czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMettRNA f

e) w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 2128 nukleotydów

a) powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10-20 minut

c) może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

f) może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu

b) może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego.

d) może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II.

f) Rozpoczęcie elongacji towarzyszy zmiana konformacyjna holoenzymu polimerazy RNA skutkiem czego pokrywa ona mniejszy odcinek DNA (3040bp).

d) wzbogacenie sekwencji 10 w pary GC wpływa na proces rozpoznania promotora przez podjednostkę polimerazy RNA

c) w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10

a) rdzeń polimerazy RNA rozpoznaje sekwencję promotora i łączy się z nim

e) w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów

b) zmiana sekwencji bloku/kasety 35 promotora ma bezpośredni wpływ na przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty.

a) nie jest możliwe, aby niewłaściwie sfałdowane białko przyjęło właściwą dla siebie konformację.

b) gdyby w komórce proces fałdowania polipeptydu przebiegał, gdy dostępna jest tylko jego część, to mogłoby zmniejszyć prawdopodobieństwo występowania nieprawidłowych odgałęzień ścieżki 8 fałdowania

d) niektóre z intein posiadają aktywność endonukleazy, która może specyficznie przeciąć gen nie zawierający inteiny, co jest wymagane do ukierunkowanego przemieszczania się sekwencji intronu inteiny

e) niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowaogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie.

f) białka opiekuńcze decydują o trzeciorzędowej strukturze białek

c) inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających

d) Synchronizacja replikacji DNA z podziałem komórkowym

e) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów ds. DNA opisuje grupa plektonemiczna

b) Trudności związane z syntezą DNA na nici opóźnionej

c) Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA

f) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów DNA opisuje grupa toponemiczna

a) Zablokowanie miejsc replikacji DNA przez nukleosomy

b) zaprogramowana zamian fazy odczytu występuje wyłącznie w bakteriach

c) zmiana fazy odczytu polega na tym, iż w czasie translacji mRNA rybosom zatrzymuje się, przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

f) wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka.

a) w przypadku kilku mRNA obserwuję się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu.

d) poślizg rybosomy umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.

e) pominięcie translacyjne zaczyna się i kończy zawsze na dwóch identycznych kodonach.

e) U ssaków CTD zawiera 52 powtórzenia siedmioaminokwasowej sekwencji TyrSerProThrSerProSer. Dwie z reszt Pro w każdym powtórzeniu mogą być modyfikowane przez dodanie grup fosforanowych

c) CTD jest zaangażowane w oddziaływanie z czynnikami białkowymi biorącymi udział w procesach molekularnych towarzyszących terminacji transkrypcji

b) Kompleks białkowy zwany mediatorem bezpośrednio aktywuje inicjację transkrypcji przez fosforylację CTD

f) Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.

a) Jej fosforylacja warunkuje przyłączenie się polimerazy do kompleksu preinicjacyjnego

d) Status jej fosforylacji jest stały podczas trwania procesu transkrypcji – zmienia się na etapie inicjacji, podczas trwania transkrypcji jest taki sam

f) Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe

a) Polimeraza DNA kopiująca nić opóźnioną tworzy kompleksy dimeryczne

d) Enzymy i pozostałe białka biorące udział w replikacji tworzą duże struktury wewnątrzjądrowe tzw. fabryki replikacyjne, z których każda zawiera odpowiednik bakteryjnego replisomu

c) Koniec 5’startera używanego przez polimerazę DNA zawiera resztę 5’ fosforanową , blokuje aktywność enzymatyczną nukleazy oznaczanej skrótem FEN1

e) Chromatydy siostrzane są związane razem aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączone są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne

b) Zakończenie syntezy fragmentu Okazaki wymaga usunięcia sekwencji startera odpowiednią polimerazą posiadającą aktywność egzonukleazy