Pytania i odpowiedzi
Biochemia I - 1
Zebrane pytania i odpowiedzi do zestawu.
Ilość pytań: 123
Rozwiązywany: 872 razy
Pytanie 1
Wybierz prawidłowe zakończenie następującego zdania: RNA charakteryzuje się tym, że...
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
... pełni rolę pośrednika w przepływie informacji genetycznej.
... może być składnikiem rybosomu.
... często zachodzi wewnątrzłańcuchowe parowanie zasad.
... jest liniowym polimerem.
... jego rdzeń jest zbudowany z powtarzających się jednostek cukrowo-fosforanowych.
Pytanie 2
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących enzymów wykorzystujących jedną z reszt aminokwasowych jako silny nukleofil do hydrolizy wiązania peptydowego są prawdziwe?
W przypadku niektórych proteaz w powstawaniu silnie reaktywnego nukleofilu zamiast histydyny uczestniczy bezpośrednio pierwszorzędowa grupa aminowa pochodząca z reszty lizylowej lub z aminowego końca enzymu.
Jedną z istotnych strategii generowania silnego nukleofilu jest tzw. triada katalityczna.
Podobną do chymotrypsyny strategię triady katalitycznej wykorzystują proteazy uczestniczące w kaskadzie krzepnięcia krwi.
Rolę kluczowego nukleofilu w niektórych proteazach pełni reszta treonylowa
Chymotrypsyna, trypsyna i elastaza są białkami homologicznymi, ale wykazują odmienną specyficzność substratową z powodu różnic w budowie kieszeni S1 wiążącej substrat.
Pytanie 3
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących lipidów błon biologicznych są prawdziwe?
Fosfoglicerydy są fosfolipidami błonowymi zbudowanymi na bazie kwasu fosfatydowego.
Zarówno gangliozydy, jak i cerebrozydy są sfingolipidami
Glikolipidy są sfingolipidami i zawierają fragmenty cukrowe
Pytanie 4
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu reakcji katalizowanej przez ludzką anhydrazę węglanową II są prawdziwe?
Rola jonu cynku polega na obniżeniu pKa z wartości >15 dla samej wody do wartości rzędu 7 dla kompleksu [His3Zn2+]H2O.
Kataliza wymaga aktywacji cząsteczki wody przez jon Zn2+.
Pytanie 5
Aktywacja zymogenów trzustkowych rozpoczyna się od:
Żadna z odpowiedzi nie jest prawidłowa.
Pytanie 6
Które z poniższych stwierdzeń na temat chymotrypsynogenu (ChTg) oraz procesu jego aktywacji są prawdziwe?
Kluczowym zjawiskiem dla nabycia aktywności katalitycznej przez ChTg jest proteolityczne utworzenie nowego końca aminowego, który przemieszcza się do wnętrza białka i tworzy dodatkowe wiązanie jonowe z obecną tam ujemnie naładowaną grupą karboksylową.
ChTg jest pojedynczym łańcuchem polipeptydowym.
Pytanie 7
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących kaskady krzepnięcia krwi są prawdziwe?
Białko C jest aktywowaną przez trombinę proteazą, która degraduje czynniki krzepliwości Va i VIIIa.
Pytanie 8
. Które z poniższych reakcji mogą być katalizowane przez kinazy NMP?
AMP + ATP ↔ 2ADP.
AMP + GTP ↔ ADP + GDP
Pytanie 9
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących struktury ATP są prawdziwe?
ATP zawiera dwa bezwodnikowe wiązania fosforanowe.
Zasada azotowa wchodzącą w skład ATP to adenozyna.
Pytanie 10
Które z następujących stwierdzeń na temat aktywnego transportu jonów Na+, K+ oraz Ca2+ są prawdziwe?
Pompa Ca2+ jest zdolna do utrzymania nawet tysiąckrotnie niższego stężenia jonów Ca2+ w cytozolu komórki mięśniowej niż w retikulum sarkoplazmatycznym.
Zarówno pompa Na+-K+, jak i pompa Ca2+, należą do ATPaz typu P.
Pytanie 11
Stężenie jonów Na+ na zewnątrz i w środku komórki wynosi odpowiednio: 143 i 14,0 mM, a stężenie jonów K+ odpowiednio: 4,0 i 157 mM. Potencjał transbłonowy układu w temperaturze 37°C wynosi - 50 mV. R = 8.31 J·K-1·mol-1, F = 96.5 kJ·V-1·mol-1.
Proszę wskazać te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.
Równoczesny transport jonów Na+ na zewnątrz komórki oraz jonów K+ do środka komórki w tych warunkach może przeprowadzać wyłącznie pompa Na+-K+ hydrolizująca ATP.
W podanych warunkach zmiana entalpii swobodnej transportu jonu Na+ na zewnątrz komórki wynosi około +10.8 kJ·mol-1, a transportu jonu Na+ do środka komórki około -10.8 kJ·mol-1.
Pytanie 12
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu katalitycznego chymotrypsyny są prawdziwe?
Związkiem pośrednim w reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę jest acyloenzym.
Kluczowa reszta katalityczna chymotrypsyny ulega modyfikacji w obecności organicznych fluorofosforanów, takich jak diizopropylofluorofosforan, co nieodwracalnie inaktywuje enzym.
Ładunek ujemny tetraedrycznego produktu pośredniego reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę jest stabilizowany dzięki oddziaływaniom z grupami NH białka w miejscu nazywanym dziurą oksyanionową.
Pytanie 13
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących katalizy enzymatycznej są prawdziwe?
Enzymy katalizują reakcje chemiczne poprzez preferencyjne wiązanie stanu przejściowego reakcji w porównaniu z jej substratami i produktami.
Istotny wkład w katalizę enzymatyczną ma przybliżanie oraz odpowiednie wzajemne orientowanie substratów reakcji wielosubstratowych.
Kataliza elektrostatyczna polega na ułatwieniu powstania lub stabilizacji stanu przejściowego za pomocą naładowanych grup enzymu lub za pomocą kofaktorów obdarzonych ładunkiem.
Pytanie 14
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu reakcji katalizowanej przez enzym restrykcyjny EcoRV są prawdziwe?
Eksperymentalnie wykazano, że reakcja hydrolizy wiązania fosfodiestrowego zachodzi z odwróceniem konfiguracji stereochemicznej na atomie fosforu.
Prawdziwość udziału w tej reakcji nukleofila (Nu) można zweryfikować za pomocą analizy stereochemicznej produktów hydrolizy chiralnych, tiofosforanowych pochodnych DNA, które zamiast jednego atomu tlenu w wiązaniu fosfodiestrowym zawierają atom siarki.
Pytanie 15
Które z poniższych białek syntetyzowane są w postaci nieaktywnej i podlegają aktywacji na drodze proteolitycznej?
Lipaza trzustkowa.
Kolagen.
Chymotrypsyna.
Czynnik X krzepliwości krwi.
Pytanie 16
Na schemacie przedstawiono wyniki mutagenezy ukierunkowanej pewnej proteazy serynowej. Zaznaczone reszty tworzące triadę katalityczną zastępowano alaniną i mierzono aktywność zmutowanego punktowo enzymu (zielone słupki) wyznaczając wartość log10(kkat). Podobnie zbadano enzym zawierający alaninę we wszystkich trzech pozycjach triady (niebieski słupek). Dla porównania na schemacie przedstawiono wynik pomiaru aktywności dla enzymu niezmutowanego (czerwony słupek) oraz szybkość reakcji niekatalizowanej (czarny słupek).
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących roli poszczególnych reszt w katalizie uważasz za najbardziej prawdopodobne na podstawie danych uzyskanych w tym eksperymencie? Załóż, że każda z wprowadzonych mutacji zmienia wyłącznie strukturę pierwszorzędową enzymu.
Mutacja reszty histydylowej na alaninę praktycznie uniemożliwia atak reszty serylowej na wiązanie peptydowe substratu.
Pewien wkład w katalizę mają także inne mechanizmy niż te związane bezpośrednio z triadą katalityczną.
Pytanie 17
Które ze stwierdzeń dotyczących glikoprotein są prawdziwe ?
Niektóre lektyny funkcjonują jako białka opiekuńcze w procesie zwijania białek.
W komórkach ludzkich glikozylacja typu O jest przeprowadzana jedynie w aparacie Golgiego.
Pytanie 18
Pytanie 19
Szlaki kataboliczne i anaboliczne właściwe danej cząsteczce biologicznej są niemal zawsze odrębne ponieważ:
byłoby niezwykle trudno regulować szlak metaboliczny, gdyby pełnił on zarówno funkcję kataboliczną jak i anaboliczną.
reakcje katalizowane przez enzymy są nieodwracalne.
Pytanie 20
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących przedstawionego etapu reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę są prawdziwe?
Na rysunku przedstawiono powstawanie tetraedrycznego stanu przejściowego, o którym wiadomo, że jest stabilizowany przez tzw. dziurę oksyanionową.
Reszty oznaczone na rysunku cyframi od 1 do 3 stanowią triadę katalityczną enzymu
Na tym etapie reakcji udział reszty 2 w katalizie polega na znaczącym obniżeniu pK reszty 3, dzięki czemu reszta 3 staje się silnym nukleofilem.