Katalizują procesy oksydo-redukcyjne (reakcje przenoszenia elektronów i protonów na różne akceptory.

Katalizują reakcje przenoszenia grup funkcujnych z cząsteczki donora na cząsteczkę akceptora (np. gr.metylowa-transmetylazy, gr.aminowa - transaminazy.

Katalizują rozpad cząsteczek złożonych na prostsze przy udziale wody (hydroliza wiązań estrowych - esterazy, glikozydowych - glikozydazy).

Katalizują reakcje addycji wody, amoniaku, dwutlenku węgla do wiązań podwójnych.

Przebudowują strukturę cząsteczki bez jej rozkładu (wewnątrzcząsteczkowe przegrupowanie atomów, czyli izomeria).

Katalizują reakcje łączenia dwóch substratów, w wyniku czego powstają wiązania C-O, C-S, C-N, C-C.